Navodi se da je Milatović postigao dogovor sa čelnicima Košarkaškog saveza i na funkciji selektora zamijeniće Miodraga Baletića, kome je ljetos, nakon Evropskog prvenstva u Francuskoj, istekao ugovor
Milatović je novembra 2006. godine izabran za selektora košarkašica Crne Gore, ali tu funkciju nije obavljao jer je otišao za Kinu, pa je šansu 2007. dobio Baletić.
Trenersku karijeru počeo je u Ljuboviću, radio je u Budućnosti, sarajevskom Željezničaru, ŽKK Bečeju, Lovćenu, FMP Železniku, Crvenoj zvezdi, Kini, ŽKK Budućnost i Kini, gdje je ostao pet godina.
Trenutno obavlja funkciju šefa stručnog štaba KK Ulcinj.