Žrijeb je zakazan za 16 časova, poslije toga biće održan tehnički sastanak svih klubova učesnika.
Na osnovu uspješnosti u eurokupovima u posljednje tri godine timovi su podijeljeni u četiri šešira. Među nosiocima su Valensija, Galatasaraj, Uniks, Kahasol, Nimburk, Le Man, Bilbao, Spartak Sankt Peterburg.
U drugom šeširu smješteni su Jerusalim, Cibona, Lokomotiva (Kuban), Sasari, Trijumf, Banvit, Panionios i Budućnost. Treći šešir čine Crvena zvezda Diva, Riga, Budivelnik, Šole, Ostende, Šarlroa, Azomvaš i Donjeck, dok su u posljednjem šeširu Orlan, Ulm, Prienai, Artland, Trefl Sopot, Vurcburg, Zielona Gora i Lukoil.
Žrijeb će biti poludirigovan, što znači da u istoj grupi neće moći da se nađu timovi iz jedne zemlje, a to se podrazumijeva i za timove iz Jadranske lige.
Prvo kolo Eurokupa igra se 7. novembra, a 32 tima biće podijeljeni u osam grupa po četiri.
U prvoj fazi po grupama igraće se po dvokružnom bod sistemu. Po dvije prvoplasirane ekipe izboriće učešće u TOP 16 fazi koju će činiti četiri grupe sa po četiri tima. I u Top16 fazi će se igrati po dvokružnom bod sistemu, a po dvije prvoplasirane ekipe iz sve četiri grupe igraće u četvrtfinalu.
Četvrtfinalni i polufinalni mečevi igraće se kod kuće i na strani, a odlučivaće koš razlika, dok će se u finalu igrati samo jedan meč. Finale je zakazano za 13. april 2013. godine, a pobjednik Eurokupa obezbijediće direktno plasman u Euroligu naredne sezone.
