Prvo kolo Eurokupa igra se 7. novembra. U prvoj fazi po grupama igraće se po dvokružnom bod sistemu. Po dvije prvoplasirane ekipe izboriće učešće u TOP 16 fazi koju će činiti četiri grupe sa po četiri tima. I u Top16 fazi će se igrati po dvokružnom bod sistemu, a po dvije prvoplasirane ekipe iz sve četiri grupe igraće u četvrtfinalu.
Četvrtfinalni i polufinalni mečevi igraće se kod kuće i na strani, a odlučivaće koš razlika, dok će se u finalu igrati samo jedan meč. Finale je zakazano za 13. april 2013. godine, a pobjednik Eurokupa obezbijediće direktno plasman u Euroligu naredne sezone.
Grupa A
Nimburk
HapoelJerusalim
Budiveljnik
Prienai
Grupa B
Bilbao
KK BUDUCNOST VOLI
Šarloa
Lukoil
Grupa C
Le Man
Trijumf
Riga
Artland
Grupa D
Valensija
Banvit
Azovmaš
Vurcburg
Grupa E
Galatasaraj
Lokomotiva Kuban
Donjeck
Trefl
Grupa F
Uniks
Panionios
Ostende
Zielona Gora
Grupa G
Spartak Sankt Peterburg
Cibona
Šole
Ulm
Grupa H
Kahasol
Sasari
Crvena Zvezda
Orlan
