Tokom službe, Joanikije je naglasio njegovanje "bliskih i dobrih odnosa sa bratskom Rusijom", te "njegovanje duhovnih i kulturnih i bratskih veza sa bratskim ruskim narodom i sa svima drugim pravoslavnim".
Kazao je da su ruska crkva, narod i država suočeni sa iskušenjem, te da se "moli za pravedno rješenje".
"Kada su bila mnoga iskušenja ruski Patrijarh blaženopočivši Aleksej i sadašnji Patrijarh, tada mitropolit, Svjatjejši Kirilo, oni su dolazili k nama i hrabrili i tješili naš narod. Njihova duhovna i moralna, bratska pomoć i podrška nama je značila mnogo i davala nam snage da izdržimo sva iskušenja koja su nas tada snalazila. Ja bih sada, kada je cijelom ruskom narodu teško i cijeloj Ruskoj pravoslavnoj crkvi, zablagodario na tadašnjoj pažnji Ruske crkve koja se naravno nastavila, i nastaviće se i ubuduće, i ako mogu što, mogu da se molim za vas i za mir, i za prevazilaženje iskušenja i za pravedno rešenje u ovim iskušenjima kojima je danas zahvaćena Ruska pravoslavna crkva i ruski narod i ruska država”, rekao je on.
Dodao je kako vjeruje "u snagu Ruske pravoslavne crkve koja je preživjela najteža iskušenja u boljševičko-komunističkom vremenu gonjenja i stradanja".
